Champignons bénéfiques et prévention des maladies

Lorsque vous utilisez le mot « champignon », voyez-vous uniquement des « mauvais champignons » ou voyez-vous aussi de « bons champignons » ? Vous imaginez des morilles, de longs brins blancs de mycélium sous une bûche morte dans les bois, ou encore de la pénicilline ? Ou voyez-vous seulement de mauvais champignons qui causent des maladies des plantes telles que l'anthracnose, la pourriture botrytique, le mildiou ou la pourriture fusarienne ?

Les champignons sont tout cela et plus encore. Les champignons sont microscopiques; les morilles sont les fructifications d'un corps beaucoup plus grand de cellules. Les brins blancs sous cette bûche morte sont des masses d'hyphes fongiques appelées mycéliums. Penicillium est une bouée de sauvetage. Pourtant, les mauvais champignons causent, en moyenne, une perte de 16 %/an de la production agricole dans le monde. (1) Ce n'est pas étonnant que vous pensiez d'abord aux mauvais champignons !

Les rôles des champignons dans le sol

Une cuillère à soupe de sol sain contient 50 milliards de micro-organismes. Le mycologue David Hawksworth, déclare que "... l'ampleur de la diversité fongique a été estimée 'de manière conservatrice' à 1.5 million d'espèces." (2) Un sol sain abrite environ 25,000 XNUMX espèces de champignons; d'autres sont aquatiques, certains vivent dans les entrailles des mammifères et certains sont des habitants des feuilles. Mais peu importe où ils se trouvent, ce sont principalement de bons champignons. Sans eux, nous ne pourrions pas cultiver ou digérer notre nourriture.

La plupart des champignons du sol sont bons et aident les plantes à absorber les nutriments et l'eau et protègent les plantes contre les maladies. Un sol sain contient également des champignons nuisibles ou pathogènes, mais avec une bonne gestion du sol, ils sont contrôlés par les bons champignons, avec l'aide de bactéries bénéfiques, nématodes et autres habitants du sol.

Quels champignons sont dans votre sol?

Il existe 3 catégories de champignons qui vivent dans le sol.

  • Décomposeurs
  • Mutualistes
  • Agents pathogènes ou parasites

La décomposeurs (ou champignons saprophytes) transforment la matière organique en acides organiques, en biomasse fongique, en dioxyde de carbone et en nutriments disponibles pour les plantes. Les décomposeurs peuvent être trouvés dans de nombreux endroits en dehors de votre sol ; dans votre composteur, tas de copeaux de bois, sur le yaourt oublié dans votre réfrigérateur, ou dans un tas de feuilles mortes. Ils préfèrent les environnements sombres et humides et, comme ils sont microscopiques, seuls leurs organes reproducteurs (ou champignons) sont généralement visibles. Lorsque vous retournez un tas de feuilles, vous remarquerez que les couches inférieures sont traversées par des brins blancs. Ce sont du mycélium, ou des masses d'hyphes fongiques. Un hyphe fongique est invisible à l'œil nu, mais lorsque vous voyez du mycélium, c'est comparable à la différence entre une dépendance dans la campagne du Kansas et la masse d'unités de logement à New York.

Les champignons décomposent toute la matière organique grâce à l'utilisation d'enzymes :

« Les champignons se nourrissent en sécrétant des enzymes à l'extrémité de leurs hyphes. Au lieu d'engloutir de la nourriture comme une amibe ou de l'ingérer et de la digérer comme un animal, ils déversent des enzymes sur la nourriture elle-même et après qu'elle se soit décomposée en molécules plus petites, elles l'aspirent à travers leurs hyphes. (3)

Les nutriments dont les champignons n'ont pas besoin pour leur croissance sont libérés dans le sol et utilisés par les plantes et autres micro-organismes. Les champignons décomposeurs sont responsables de l'azote, du phosphore et de nombreux oligo-éléments nécessaires à une forte croissance.

La mutualistes ont une relation cellulaire avec les plantes. Ils apportent des nutriments et de l'eau aux plantes en échange de carbone sous forme d'exsudats de racines de plantes. Les mutualistes se présentent sous deux formes distinctes; ectomycorhizien ou endomycorhizien.

Les champignons ectomycorhiziens se développent à la surface des racines. Ils étendent la zone disponible pour l'absorption des nutriments et de l'eau grâce à leur vaste réseau d'hyphes. Ils sont souvent associés aux arbres.

Les champignons endomycorhiziens pénètrent dans la racine de la plante et étendent leur réseau hyphe dans le sol. (Champignons mycorhiziens arbusculaires) sont un type d'endomycorhize. Ils sont capables de fournir directement à la racine de la plante des nutriments et de l'eau.

La pathogène ou parasitaire les champignons sont ce à quoi nous pensons généralement lorsque nous prononçons le mot « champignon ». Ils comprennent Phytophthora, Rhizoctonia, Pythium, Verticillium et d'autres.  Ces champignons provoquent la pourriture des racines, la pourriture des racines et de la couronne dans les arbustes, la fonte des semis, des taches enfoncées dans les feuilles des plantes, des taches de cavité, de nombreuses rouilles, la liste est longue. La plupart des maladies des plantes sont causées par des champignons pathogènes, mais moins de 10 % de tous les champignons connus colonisent les plantes. (4)

Ce sont les champignons que les scientifiques ont le plus étudiés car ils affectent notre approvisionnement alimentaire. Mais ils ne sont pas la majorité des champignons dans un sol sain. Des champignons bénéfiques tels que les mutualistes et les décomposeurs se trouvent dans le sol aux côtés de champignons pathogènes. Ils protègent les plantes contre les maladies causées par des agents pathogènes et fournissent à la plante hôte des nutriments et de l'eau.

La bataille entre les bons et les mauvais champignons

Dans une forêt où le sol n'est pas perturbé, les bons champignons gagneront presque toujours la bataille. Mais dans un champ agricole qui est labouré chaque année et des produits chimiques synthétiques appliqués, le combat peut ne pas être juste. C'est parce que les hyphes, à la fois des bons et des mauvais champignons, sont détruits par les pratiques agricoles conventionnelles telles que le travail du sol. Dans une étude menée par Dipak Sharma-Poudyal, et al

« ... les résultats suggèrent que les taxons les plus courants dans les systèmes de travail du sol conventionnels peuvent utiliser des résidus de plantes fraîches et matures qui sont transformés dans le sol avec le travail du sol en tant que colonisateurs pionniers, puis produisent un grand nombre de conidies qui ne sont pas aussi affectées par le travail du sol que le stade de vie mycélien . " (5)

Les champignons peuvent survivre pendant de longues périodes au stade des conidies, en attendant que les conditions appropriées pour développer des hyphes. Les conidies des champignons pathogènes continuent d'infecter les cultures. En raison de ces infections, les pratiques conventionnelles suggèrent que vous devez pulvériser plus de fongicides, ce qui diminue la diversité fongique. Les plantes deviennent vulnérables aux maladies causées par des champignons qui sont devenus résistants à vos fongicides.

Botrytis et de nombreux mildiou sont résistants à presque tous les fongicides. Plus il y a de produits chimiques pulvérisés sur les champs, moins la communauté microbienne est diversifiée. Une plus faible diversité augmente la prévalence des champignons pathogènes. C'est un cercle vicieux.

Comment pouvez-vous égaliser le terrain de jeu entre les bons et les mauvais champignons ?

L'utilisation de pratiques régénératives crée un meilleur équilibre des micro-organismes dans votre sol et sur vos plantes. Les systèmes de culture sans labour créent une plus grande diversité d'espèces microbiennes, de sorte que les bons et les mauvais champignons peuvent coexister. L'utilisation de produits synthétiques sans labour et décroissants permet aux champignons bénéfiques de prendre le dessus. Ils utilisent leurs mécanismes de protection pour éloigner les champignons pathogènes de vos cultures.

Il a été prouvé que même les mauvais champignons ont des avantages en tant que parasites d'insectes, créant des creux dans les arbres morts pour la nidification des animaux et piégeant des maladies causant des nématodes. Il existe tellement d'espèces de champignons, et la plupart n'ont pas été étudiées, qu'il est parfois difficile de distinguer le bon du mauvais.

Champignons bénéfiques « … formeront des toiles et des filets protecteurs, souvent en conjonction avec des bactéries, autour des racines (et même à la surface des feuilles, car les feuilles produisent des exsudats qui attirent également les bactéries et les champignons…) » pour protéger la plante hôte. (6) Lorsque des champignons bénéfiques ont la possibilité de peupler une zone, ils protègent la plante hôte (leur source de nourriture) de plusieurs manières. Ils fournissent non seulement des nutriments et de l'eau aux plantes, mais sécrètent également des enzymes qui attaquent les champignons pathogènes.

Les champignons mutualistes, dont l'AMF, créent des conditions inhospitalières pour les champignons pathogènes. Il a été démontré que les sols qui ont une grande diversité de micro-organismes, y compris les champignons, suppriment les maladies fongiques. Les bons champignons peuvent rivaliser avec les mauvais champignons pour les nutriments, les affamant essentiellement.  

Champignons - Le bon et le mauvais - En équilibre

Les bons et les mauvais champignons seront toujours là. La clé est de les maintenir en équilibre. Si vos pratiques agricoles prennent en considération tous les avantages des champignons, vous constaterez que la nature vous aidera.

Les pratiques agricoles conventionnelles diminuent les bons champignons tout en essayant de prévenir les maladies des plantes causées par les mauvais champignons. La pulvérisation de fongicides et le labourage des résidus de culture créent un environnement plus accueillant pour les mauvais champignons.

Les bons champignons ont besoin de plantes vivantes pour prospérer, les mauvais champignons se contentent de la matière organique morte que vous avez enfouie dans le sol. Juste sous la surface de ce champ que vous laissez en jachère tout l'hiver, de mauvais champignons se régalent. Réduire le travail du sol, ne pas utiliser de fongicides ou d'engrais et utiliser des cultures de couverture pour nourrir vos alliés fongiques fera une énorme différence dans la prévention des maladies dans vos champs. Il est toujours plus facile de prévenir une maladie que d'essayer de ramener une culture malade.

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  1. http://www.davidmoore.org.uk/21st_century_guidebook_to_fungi_platinum/ch14_01.htm
  2. https://www.apsnet.org/edcenter/disandpath/fungalasco/intro/Pages/IntroFungi.aspx
  3. https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0953756208620274
  4. https://science.howstuffworks.com/life/cellular-microscopic/fungi.htm
  5. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5595340/
  6. Lowenfels, Jeff, Wayne Lewis, Faire équipe avec des microbes, Timber Press, 2010, p. 72
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