Confessions d'un mangeur de bactéries

Tout a commencé quand j'avais environ 3 ans, du moins c'est la première fois que je m'en souviens. Tout était de la faute de mon père. J'étais dans le jardin avec lui et j'ai dit que j'avais faim. Il fit deux pas sur une rangée de haricots et une rangée d'épinards et arracha quelques carottes. Il a essuyé la plus grande partie de la terre sur son pantalon et m'en a tendu un. « Il y a juste quelques bactéries dessus, c'est bon pour ton intestin », m'a-t-il dit alors qu'il commençait à grignoter l'autre. Alors, j'ai fait de même. C'était un peu graveleux, mais c'était doux, et c'est comme ça que ça a commencé.

Cette carotte n'avait pas que « quelques bactéries ». Des études menées par l'USDA ont révélé qu'en moyenne, il y a 22 espèce de bactéries dans une carotte moyenne de culture biologique. Ni sur la peau, ni dans le sol, ni dans la carotte que vous mangez. Ce sont les mêmes espèces de bactéries nécessaires à la digestion, et vous les avez déjà dans votre intestin.

Mon intestin est plein de bactéries du sol ?

Oui, et des champignons, et des virus, et toutes sortes de micro-organismes qui vous gardent en bonne santé. Vous avez commencé à peupler vos intestins de bactéries et d'autres microbes au cours de votre voyage hors de l'utérus et dans le monde. Vous avez ramassé toutes les bactéries que votre mère avait accumulées, alors vous avez commencé avec un bon mélange de bactéries. Ils ne vous rendaient pas malade mais aidaient à repousser les agents pathogènes. Si vous êtes né par césarienne, vous avez manqué de nombreux microbes qui vous garderaient en bonne santé toute votre vie.

Avez-vous déjà remarqué que les enfants rampent et explorent leur monde avec leur bouche ? Mettez un enfant sur un tapis, et vous retirerez les fibres du tapis de sa bouche, posez-le sur l'herbe, et ce sera de l'herbe et de la terre. Quelles sont les fibres de tapis synthétiques les plus bénéfiques ou l'herbe verte fraîche et la terre ?

En supposant que vous n'utilisez pas de pesticides sur votre pelouse, c'est la herbe et terre. Pourquoi? Votre enfant enrichit son tractus intestinal avec des bactéries dans le sol et sur l'herbe, qui le maintiendront bien. À l'âge de trois ans, la plupart des enfants ont un microbiome complet dans leurs intestins. Ce microbiome est principalement influencé par l'environnement, le mode de vie et l'alimentation. Selon le Centre National de Biotechnologie Centre, votre contribution au titre de la génétique est inférieure à 8 %.

Regardons de plus près ce que votre enfant a mangé

La plupart des parents considèrent les bactéries comme quelque chose à désinfecter. Mais de nombreuses études, telles que Effets protecteurs de l'agriculture sur les allergies et l'asthme : avons-nous appris quelque chose depuis 1873 ? by Douwes et al., ont montré que les enfants qui grandissent dans une ferme ou sont exposés à des animaux d'extérieur sont beaucoup moins susceptibles de souffrir d'asthme, d'allergies ou de maladies auto-immunes. Quel rôle les bactéries du sol jouent-elles pour garder votre enfant et vos plantes en bonne santé ?

pont bactéries du sol protéger les plantes contre les maladies et jouer un rôle majeur dans le cycle des éléments nutritifs du sol. Lorsque votre enfant a un biome intestinal sain avec le bon ratio de bactéries, champignons et autres micro-organismes, il est aussi sain que le sol qu'il a mangé.

Les bactéries sont le micro-organisme le plus abondant dans votre sol. Selon Jeff Lowenfels dans son livre «Faire équipe avec des microbes, " une cuillère à café "… contient un milliard de bactéries invisibles, plusieurs mètres d'hyphes fongiques également invisibles, plusieurs milliers de protozoaires et quelques dizaines de nématodes."

Les bactéries du sol, bien que petites, sont puissantes dans leurs fonctions et leur multitude. Et la plupart des bactéries de votre sol dépendent de vos plantes. Oui, les plantes contrôlent le spectacle.

Comment les plantes contrôlent-elles les bactéries du sol ?

Les bactéries du sol dépendent presque totalement des plantes pour se nourrir. Selon que ces plantes sont mortes ou vivantes, différents types de bactéries du sol peuvent être trouvés. Les bactéries se répartissent en quatre groupes fonctionnels.

  • Décomposeurs – ils consomment des composés carbonés simples – racine
    Sol Soja bactérien
    exsudats et litière végétale - ils transforment la matière organique du sol en des formes utiles pour le reste du réseau trophique du sol.
  • Mutualistes – ils s'associent avec des plantes. Protéger les racines des plantes contre les agents pathogènes et fournir des nutriments en échange d'exsudats racinaires.
  • Agents pathogènes – toutes les bactéries ne sont pas bénéfiques, mais ce groupe est le plus petit, et avec un sol sain plein de décomposeurs et de mutualistes, il n'y a pas beaucoup d'espace pour qu'elles se développent.
  • Lithotrophes – au lieu de consommer du carbone, ces bactéries tirent leur énergie de l'azote, du soufre, du fer ou de l'hydrogène. Ceux-ci se trouvent généralement autour des bouches hydrothermales telles que les pots de boue dans le parc national de Yellowstone. Ce n'est pas une bactérie que vous allez trouver dans votre jardin ou votre champ.

Les espèces de bactéries actives autour des racines d'une plante dépendent de ce dont la plante a besoin.

Bactéries Mutualistes

Les espèces bactériennes mutualistes ont un flux et un reflux selon les exsudats racinaires émis par la plante. Essentiellement, la plante signale au réseau trophique du sol quels nutriments sont nécessaires pour une croissance optimale à chaque stade de développement.

Avoir une forte communauté de bactéries bénéfiques dans la rhizosphère (la zone directement autour des racines de la plante) éloigne non seulement les bactéries pathogènes des racines, mais crée également un bouclier autour de la biomasse des feuilles, des tiges et des fruits, ce qui empêche les insectes et les agents pathogènes aéroportés de accéder à l'usine.

La nature recouvre le sol de plantes même si vous n'avez rien planté. Même les mauvaises herbes ont leurs espèces bactériennes mutualistes pour les garder en bonne santé. À mesure que la structure du sol change avec l'ajout de matière organique morte et en décomposition, les types de mauvaises herbes changent et la communauté bactérienne mutualiste change également.

Bactéries décomposeurs

Les décomposeurs peuvent être trouvés partout où la matière organique est morte ou en train de mourir : votre tas de compost, les racines des fleurs qui entrent en dormance, la bûche pourrie dans votre bois, les résidus de paillis tondu dans votre pelouse. La matière organique est partout.

En tant qu'êtres humains, nous transportons notre propre charge de bactéries, à la fois dans nos intestins et sur toutes les surfaces de la peau. Nous éliminons toujours les peaux mortes et avec elles les bactéries mortes, qui ne sont jamais gaspillées mais de la nourriture pour les champignons et autres micro-organismes dans l'air et le sol.

Bactérie pathogène

Les bactéries pathogènes sont toujours autour de nous dans l'air et le sol mais peuvent être réduites au minimum. Les gens, et non les plantes, contrôlent le nombre d'agents pathogènes présents dans notre sol et notre intestin. La clé pour des plantes et des personnes saines est de maintenir une forte communauté de micro-organismes bénéfiques du sol. Des sols sains et des humains sains possèdent des micro-organismes bénéfiques qui les protègent des agents pathogènes. 

Quand produits chimiques toxiques sont pulvérisés sur un champ, les bactéries pathogènes ont plus de facilité à se rétablir car le spray toxique tue toutes les bactéries et champignons, créant des vides dans le réseau trophique du sol. La nature comblera ces vides, même si ce n'est pas bénéfique pour les cultures que vous souhaitez faire prospérer. Les bactéries pathogènes peuvent devenir dominantes, entraînant ainsi des maladies des cultures, des infestations d'insectes et la pulvérisation de produits chimiques plus toxiques.

Le cycle des bactéries pathogènes peut être rompu en incorporant des micro-organismes bénéfiques, des cultures de couverture et des pratiques agricoles sans labour dans les champs improductifs. La santé humaine peut être améliorée en mangeant plus de fruits et légumes biologiques cultivés dans un sol sain contenant ces micro-organismes bénéfiques qui inoculent votre intestin.

Les bactéries jouent de nombreux rôles dans l'écologie de votre ferme. Des bactéries bénéfiques du sol sont déjà présentes dans votre sol, mais les déséquilibres créent souvent des carences qui attirent les maladies, les insectes nuisibles et les bactéries pathogènes. L'ajout d'une biologie bénéfique profitera à vos plantes et ne déplacera pas les organismes bénéfiques indigènes.

Fonctions des bactéries du sol

Habituellement, nous pensons que les bactéries du sol sont présentes dans le champ, et elles ne pénètrent dans la maison que lorsque nous traçons dans la boue. Mais ces bactéries sont partout autour de nous, en nous et dans notre alimentation. 

Les bactéries du sol ne fertilisent pas seulement le sol avec leurs cadavres, elles servent de nourriture à leurs prédateurs. Lorsqu'ils sont consommés, les prédateurs utilisent ce dont ils ont besoin et sécrètent ensuite l'excédent sous forme de déchets. Ces déchets sont sous une forme soluble dans les plantes et disponibles pour que la plante aide à la croissance.

En cyclant les nutriments et l'eau aux plantes, les bactéries du sol sont nécessaires à la croissance et à la santé des plantes. Le sol contient de nombreux éléments nutritifs, mais la plupart ne sont pas sous une forme digestible pour les plantes. Les bactéries sont les premiers micro-organismes à amorcer la « minéralisation » de ces nutriments. Si vous nourrissez le sol, le sol prendra soin de vos plantes.

L'un des éléments essentiels majeurs pour tous les organismes vivants est le fer. La plupart des sols et de l'eau contiennent du fer en abondance, mais il ne se présente généralement pas sous une forme soluble dans les plantes. Les bactéries du sol sécrètent des sidérophores, qui sont des composés chélateurs du fer. Les bactéries transportent le fer à travers les membranes cellulaires. Un avantage secondaire de l'élimination du fer du sol est que de nombreuses bactéries pathogènes ont également besoin de fer et que la plante reçoit le fer en premier.

« Le fer a plusieurs rôles au sein d'une cellule bactérienne. Il est nécessaire pour rendre actives de nombreuses protéines et enzymes différentes dans une variété de processus métaboliques. Il est également essentiel pour l'expression de nombreux déterminants clés de la virulence. Sans fer, il est presque impossible pour les bactéries de s'établir dans l'hôte et de provoquer des maladies.

Les plantes forment des relations mutualistes avec les bactéries en fonction des besoins des plantes. Les bactéries du sol qui sont « autorisées » à accéder à l'intérieur de la racine de la plante sont appelées « bactéries endophytes ». Comme toutes les bactéries, ce sont des organismes microscopiques unicellulaires qui commencent leur vie en tant que bactéries du sol.

Un petit sous-ensemble de bactéries dans la rhizosphère a les caractéristiques bénéfiques pour la plante. Le microbiote de l'endosphère est assemblé par la plante mais la compétition et la coopération microbiennes entrent également en jeu. C'est un processus complexe pour devenir une bactérie endophyte.  

Les fonctions des bactéries endophytes

Bactéries qui passent au moins une partie de leur vie dans l'usine remplir un certain nombre de fonctions pour la plante. L'étude des bactéries endophytes (EB) est relativement nouvelle et la plupart des informations sur leur fonction proviennent des laboratoires. Les pédologues sont conscients que l'EB peut jouer un plus grand nombre de rôles, mais les essais sur le terrain en sont à leurs balbutiements. Les tests d'efficacité ne sont pas à la hauteur de l'agriculture biologique. Ce sont les avantages des bactéries endophytes que les scientifiques du sol ont découverts à ce jour.

  • Favoriser la croissance des plantes en fournissant aux plantes des nutriments
  • Produire diverses hormones végétales pour favoriser la croissance et la fructification
  • Tolérance accrue au stress dû au froid
  • Meilleure tolérance à la sécheresse
  • Cycle de l'azote dans la plante
  • Renforcement du système immunitaire de la plante
  • Plantes de choix pour des réponses de défense plus rapides contre les agents pathogènes

Les bactéries sont étonnantes et remplissent de nombreux rôles dans l'agriculture. 

Peut-être qu'en travaillant avec la nature, plutôt que contre elle, vous pouvez lancer une révolution plus verte dans vos champs.

Tu te souviens de cette petite fille qui mangeait des bactéries ? Elle mange toujours des carottes du jardin, pleines de bactéries mais généralement lavées – le grain n'est plus ce qu'il était. Comme le sien, votre intestin peut en bénéficier le plus en ne pelant pas vos pommes de terre ou vos plantes-racines - pourquoi jeter toutes ces bactéries bénéfiques ?

Votre intestin et votre sol 

Le sol a contribué au microbiome intestinal humain - le système digestif humain a changé au fil du temps, passant du régime alimentaire des chasseurs-cueilleurs à la restauration rapide d'aujourd'hui. Les bactéries du sol et les bactéries intestinales sont incroyablement similaires.

Au cours des dernières décennies, les contacts avec le sol et les bactéries sont devenus moins fréquents. Avec le mode de vie moderne et l'évolution de la consommation nutritionnelle, nos microbiomes intestinaux deviennent moins diversifiés que jamais. L'agriculture commerciale, en mettant l'accent sur les engrais synthétiques, a diminué la microbiologie du sol et la qualité nutritionnelle des aliments que nous consommons. Ces actions ont eu des effets néfastes à la fois sur la santé des sols et la santé humaine.

N'est-il pas temps de reconsidérer notre rapport au sol et aux aliments que nous consommons ?  

 

Remarque : Ce blog met en évidence le rôle des bactéries dans le réseau trophique. Il y a plus de micro-organismes qui sont importants pour le réseau trophique et qui interagissent avec les bactéries.

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